MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 DNA

Total Repeats: 39047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020819	GTT	2	6	151	156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405736
2	NC_020819	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405736
3	NC_020819	CAA	2	6	226	231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405736
4	NC_020819	GAAA	2	8	445	452	75 %	0 %	25 %	0 %	472405736
5	NC_020819	TGC	2	6	517	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405736
6	NC_020819	TGG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405736
7	NC_020819	GAA	2	6	539	544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405736
8	NC_020819	CTT	2	6	568	573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405736
9	NC_020819	TGG	2	6	577	582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405736
10	NC_020819	CAA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405736
11	NC_020819	AGA	2	6	634	639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405736
12	NC_020819	TTA	2	6	693	698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405736
13	NC_020819	CTG	3	9	755	763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405736
14	NC_020819	GAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405736
15	NC_020819	TTC	2	6	779	784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405736
16	NC_020819	TAA	2	6	787	792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472405736
17	NC_020819	GGAA	2	8	793	800	50 %	0 %	50 %	0 %	472405736
18	NC_020819	TTC	2	6	812	817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405736
19	NC_020819	ATG	3	9	837	845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405736
20	NC_020819	GAT	2	6	1019	1024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405736
21	NC_020819	ACCA	2	8	1116	1123	50 %	0 %	0 %	50 %	472405736
22	NC_020819	GCT	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405736
23	NC_020819	GAAA	2	8	1254	1261	75 %	0 %	25 %	0 %	472405736
24	NC_020819	TGG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405736
25	NC_020819	CAA	2	6	1782	1787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405737
26	NC_020819	ACT	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405737
27	NC_020819	TTA	2	6	1867	1872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405737
28	NC_020819	TGA	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405737
29	NC_020819	GCT	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405737
30	NC_020819	AAT	2	6	2098	2103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472405737
31	NC_020819	GTT	2	6	2140	2145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405737
32	NC_020819	AATTG	2	10	2301	2310	40 %	40 %	20 %	0 %	472405737
33	NC_020819	GAT	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405737
34	NC_020819	CTT	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405737
35	NC_020819	ACG	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405737
36	NC_020819	TTA	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405737
37	NC_020819	GCA	2	6	2554	2559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405737
38	NC_020819	CT	3	6	2571	2576	0 %	50 %	0 %	50 %	472405737
39	NC_020819	AAC	2	6	2596	2601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405737
40	NC_020819	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405737
41	NC_020819	TTCA	2	8	2845	2852	25 %	50 %	0 %	25 %	472405737
42	NC_020819	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405738
43	NC_020819	T	6	6	2979	2984	0 %	100 %	0 %	0 %	472405738
44	NC_020819	GTG	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405738
45	NC_020819	TGCG	2	8	3060	3067	0 %	25 %	50 %	25 %	472405738
46	NC_020819	A	6	6	3303	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	472405739
47	NC_020819	GAA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405739
48	NC_020819	CGG	2	6	3441	3446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405739
49	NC_020819	ATT	2	6	3494	3499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405739
50	NC_020819	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	472405739
51	NC_020819	AAT	2	6	3523	3528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472405739
52	NC_020819	TGCAGC	2	12	3543	3554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472405740
53	NC_020819	GTT	2	6	3746	3751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405740
54	NC_020819	CG	5	10	3803	3812	0 %	0 %	50 %	50 %	472405740
55	NC_020819	GC	3	6	3903	3908	0 %	0 %	50 %	50 %	472405740
56	NC_020819	CGG	2	6	3917	3922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405740
57	NC_020819	TATGGA	2	12	3928	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
58	NC_020819	AGC	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
59	NC_020819	ATT	2	6	4100	4105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405740
60	NC_020819	GCA	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
61	NC_020819	GAA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405740
62	NC_020819	GAT	2	6	4217	4222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
63	NC_020819	CCA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405740
64	NC_020819	CGG	2	6	4248	4253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405740
65	NC_020819	AGC	2	6	4275	4280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
66	NC_020819	TGG	2	6	4311	4316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405740
67	NC_020819	CAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405740
68	NC_020819	TTGAT	2	10	4425	4434	20 %	60 %	20 %	0 %	472405740
69	NC_020819	AGA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405740
70	NC_020819	TTA	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405740
71	NC_020819	TGA	2	6	4471	4476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
72	NC_020819	GAT	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405740
73	NC_020819	GC	3	6	4499	4504	0 %	0 %	50 %	50 %	472405740
74	NC_020819	ACC	3	9	4553	4561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405740
75	NC_020819	TGG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405740
76	NC_020819	GCA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405740
77	NC_020819	AGG	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472405740
78	NC_020819	CAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405741
79	NC_020819	CGA	2	6	4800	4805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405741
80	NC_020819	TGA	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
81	NC_020819	TCAA	2	8	4899	4906	50 %	25 %	0 %	25 %	472405741
82	NC_020819	AGA	2	6	4962	4967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
83	NC_020819	GGT	2	6	5012	5017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405741
84	NC_020819	CGG	2	6	5023	5028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405741
85	NC_020819	GGT	2	6	5048	5053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405741
86	NC_020819	CTT	2	6	5224	5229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405741
87	NC_020819	CCAGAT	2	12	5231	5242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	472405741
88	NC_020819	GAC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405741
89	NC_020819	CTT	2	6	5305	5310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405741
90	NC_020819	TGA	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
91	NC_020819	GAA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
92	NC_020819	GAC	2	6	5504	5509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405741
93	NC_020819	CAA	2	6	5536	5541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405741
94	NC_020819	GAA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
95	NC_020819	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
96	NC_020819	GAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
97	NC_020819	ATG	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
98	NC_020819	TGC	2	6	5875	5880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405741
99	NC_020819	GAA	2	6	5905	5910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
100	NC_020819	TCG	2	6	5991	5996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405741
101	NC_020819	CTG	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405741
102	NC_020819	CAAG	2	8	6022	6029	50 %	0 %	25 %	25 %	472405741
103	NC_020819	GAA	2	6	6119	6124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405741
104	NC_020819	TGA	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
105	NC_020819	CCGATG	2	12	6213	6224	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	472405741
106	NC_020819	TGT	2	6	6249	6254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405741
107	NC_020819	ATT	2	6	6283	6288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405741
108	NC_020819	TGCC	2	8	6310	6317	0 %	25 %	25 %	50 %	472405741
109	NC_020819	TGA	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405741
110	NC_020819	CCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405741
111	NC_020819	CGG	2	6	6494	6499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405741
112	NC_020819	ATT	2	6	6663	6668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405742
113	NC_020819	TCTT	2	8	6713	6720	0 %	75 %	0 %	25 %	472405742
114	NC_020819	CCG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
115	NC_020819	GCC	2	6	7004	7009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
116	NC_020819	CAA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
117	NC_020819	GATT	2	8	7081	7088	25 %	50 %	25 %	0 %	472405742
118	NC_020819	ATG	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
119	NC_020819	GTGAAC	2	12	7110	7121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472405742
120	NC_020819	CCG	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
121	NC_020819	TCA	2	6	7224	7229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405742
122	NC_020819	TGA	2	6	7245	7250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
123	NC_020819	TGG	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405742
124	NC_020819	CGG	2	6	7343	7348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405742
125	NC_020819	GAA	3	9	7400	7408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
126	NC_020819	AAC	2	6	7419	7424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
127	NC_020819	CAA	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
128	NC_020819	ATTG	2	8	7468	7475	25 %	50 %	25 %	0 %	472405742
129	NC_020819	TGAT	2	8	7563	7570	25 %	50 %	25 %	0 %	472405742
130	NC_020819	CGG	2	6	7574	7579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405742
131	NC_020819	CCT	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472405742
132	NC_020819	TAC	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405742
133	NC_020819	CCG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405742
134	NC_020819	ATT	2	6	7838	7843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405742
135	NC_020819	CAAG	2	8	7870	7877	50 %	0 %	25 %	25 %	472405742
136	NC_020819	ACAA	2	8	7905	7912	75 %	0 %	0 %	25 %	472405742
137	NC_020819	CAA	2	6	8042	8047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
138	NC_020819	CAT	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405742
139	NC_020819	GAA	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
140	NC_020819	GAA	2	6	8159	8164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
141	NC_020819	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405742
142	NC_020819	GAT	3	9	8273	8281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
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144	NC_020819	TTC	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405742
145	NC_020819	CAA	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472405742
146	NC_020819	ACG	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405742
147	NC_020819	AGA	2	6	8590	8595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405742
148	NC_020819	TGAT	2	8	8604	8611	25 %	50 %	25 %	0 %	472405742
149	NC_020819	ATT	2	6	8618	8623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472405742
150	NC_020819	AAAC	2	8	8819	8826	75 %	0 %	0 %	25 %	472405742
151	NC_020819	GCT	3	9	8828	8836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405742
152	NC_020819	GAC	2	6	8917	8922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405742
153	NC_020819	CGA	2	6	8932	8937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472405742
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156	NC_020819	AGT	2	6	9109	9114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405742
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158	NC_020819	TTAA	2	8	9181	9188	50 %	50 %	0 %	0 %	472405742
159	NC_020819	T	6	6	9228	9233	0 %	100 %	0 %	0 %	472405743
160	NC_020819	GTA	2	6	9322	9327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405743
161	NC_020819	GCCC	2	8	9381	9388	0 %	0 %	25 %	75 %	472405743
162	NC_020819	ACT	2	6	9959	9964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405744
163	NC_020819	CAT	2	6	9982	9987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405744
164	NC_020819	TGA	2	6	10000	10005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405744
165	NC_020819	TGC	2	6	10006	10011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472405744
166	NC_020819	TGG	2	6	10114	10119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405744
167	NC_020819	TGA	2	6	10162	10167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405744
168	NC_020819	AGT	2	6	10294	10299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405745
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172	NC_020819	CTT	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405745
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243	NC_020819	A	6	6	14896	14901	100 %	0 %	0 %	0 %	472405750
244	NC_020819	GTAT	2	8	15007	15014	25 %	50 %	25 %	0 %	472405750
245	NC_020819	GCG	2	6	15083	15088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405750
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250	NC_020819	CT	3	6	15278	15283	0 %	50 %	0 %	50 %	472405750
251	NC_020819	GAA	2	6	15344	15349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472405750
252	NC_020819	GAT	2	6	15442	15447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472405750
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258	NC_020819	TGG	2	6	16044	16049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405751
259	NC_020819	GCC	2	6	16140	16145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472405751
260	NC_020819	GCG	2	6	16151	16156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472405751
261	NC_020819	TGG	2	6	16161	16166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472405751
262	NC_020819	CTT	2	6	16168	16173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472405751
263	NC_020819	ACC	2	6	16241	16246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472405751
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265	NC_020819	CCGG	2	8	16379	16386	0 %	0 %	50 %	50 %	472405751
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272	NC_020819	GTT	2	6	16773	16778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472405751
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275	NC_020819	TAAT	2	8	16879	16886	50 %	50 %	0 %	0 %	472405752
276	NC_020819	AACC	2	8	16952	16959	50 %	0 %	0 %	50 %	472405752
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283	NC_020819	TTGC	2	8	17576	17583	0 %	50 %	25 %	25 %	472405753
284	NC_020819	TAAA	2	8	17644	17651	75 %	25 %	0 %	0 %	472405753
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295	NC_020819	TAC	2	6	18339	18344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472405754
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385	NC_020819	CAAC	2	8	24198	24205	50 %	0 %	0 %	50 %	472405760
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500	NC_020819	ATCG	2	8	31030	31037	25 %	25 %	25 %	25 %	472405768

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